IT+BT深度融合的时代下，未来行业方向在何方？发表时间：2022-07-26 10:00 ZAODX世界肿瘤早筛大会——分论坛 基因科技大数据发展论坛 7月15-17日，国内首个聚焦于肿瘤早筛的盛会——ZAODX世界肿瘤早筛大会在广州长隆国际会展中心召开，大会聚焦全球早筛前沿技术研发和转化应用，构建全球顶级交流平台，帮助产业提升全球化合作能力和科技成果市场转化应用能力。 7月15日下午，大会分论坛“基因科技大数据发展论坛”顺利举办，论坛邀请了众多行业大咖嘉宾上台演讲，包括：百度智能云生命科学解决方案总监陈博先生；NVIDIA医疗行业高级顾问张青青女士；赛业生物应用科学家、清华珠三角研究院人工智能创新中心项目负责人黄颖博士；微远基因高级研发总监曾伟奇博士；晶准生物医学（深圳）有限公司临床医学部负责人黄艳博士；永诺生物副总经理林钊先生；裕策生物副总裁、信息中心运营负责人孔德举先生；百度智能云高级解决方案工程师张之越先生。 本次大会线上线下共吸引超过400万人次观看，“基因科技大数据发展论坛”现场座无虚席，线上线下共吸引超过14万人次观看。 精彩演讲环节 陈博先生  百度智能云生命科学解决方案总监陈博先生 《"云智一体"助力生命科学领域智能化升级》陈博先生表示，“在基因行业领域，IT+BT是重要发展方向。云智一体是百度智能云的独特优势。‘适合跑AI的云’为数字化转型提供安全、稳定、灵活的数字化底座。‘智能化引擎’为智能化升级提供领先的创新技术和平台。基于‘云智一体’架构，百度智能云为生命科学领域提供包括基因检测、小/大分子药物协同研发、细胞与基因治疗、mRNA疫苗设计等服务，现已与多个生命科学企业形成合作。” 张青青女士  NVIDIA医疗行业高级顾问张青青女士 《100美元基因组时代下的数据分析 - GPU 加速软件 Clara Parabricks 介绍》在基因3.0时代，基因大数据的有效运用将为生命科学领域带来无限机遇，但普通实验室计算能力已不足以应付日益庞大的数据分析，GPU计算技术的诞生不仅有助于解决数据分析瓶颈问题，更为未来包含AI和深度学习的实验室数据分析提出了新的方向。NVIDIA研发的Clara Parabricks是一个即用型的GPU加速软件套件，从整个转录组到单细胞分析都适用于群体基因组学的DNA种系变异调用、癌症基因组学的DNA体细胞变异调用，以及RNA测序项目。整个分析流程可以让用户体验到，几个数量级的加速，同时整个流程还能保证生成和标准工具相同的100%精确的结果。 黄颖博士  赛业生物应用科学家、清华珠三角研究院人工智能创新中心项目负责人黄颖博士《罕见病数据中心及AI在遗传病诊断中的应用》 “其实罕见病并不罕见，约80%罕见病与遗传相关。”黄颖博士说道。在生物信息大数据时代，人类标准遗传表型数据逐年累积，遗传数据正呈指数增长。在这方面，广州罕见病基因治疗联盟（由清华珠三角研究院牵头组建）致力于对罕见病数据进行资源整合与信息共享，加速罕见病研究发展和医药研发。黄颖博士介绍，目前该联盟重点开发了一个罕见病数据中心（RDDC），并开发了信息可视化、AI数据分析、论文作图工具等一系列工具，为罕见病科研工作者提供助力。 曾伟奇博士  微远基因高级研发总监曾伟奇博士 《推动感染性疾病精准医疗的技术迭代——mNGS 2.0》曾伟奇博士表示，“宏基因学1.0极大程度上弥补了传统病原诊断技术的不足，解决了一部分危重的感染患者需求的“全覆盖”检测问题，但是，针对高宿主样本的性能不佳是其弊端。微远基因研发了宏基因组学2.0，其基于靶向的捕获技术实现了探针设计全覆盖已知病原、探针容错捕获近缘新发病原、磁珠及其反应体系改良，兼容新发无近缘的病原，在提升灵敏度的同时还能提升特异性。未来也能兼顾降低测序成本，实现自动化，AI辅助的特点。 黄艳博士  晶准生物医学（深圳）有限公司临床医学部负责人黄艳博士 《基因测序技术在循环肿瘤细胞检测中的应用及发展》黄艳博士从CTC单细胞测序的背景出发，阐述了CTC测序的临床意义和学术进展。黄艳博士表示，“CTC基因测序技术难点包括CTC的分离与获取、单细胞全基因组扩增等，为此，晶准医学开发了微流控芯片技术，能够尽可能多的捕获CTC的完整群体，CTC单细胞挑选系统成功率达90%上。目前，晶准医学也已经建立标准化单细胞捕获及测序流程。”对于CTC单细胞测序未来前景，黄艳博士指出，在临床应用方面，CTC基因组数据库建立将是其未来的发展方向，同时，在科研方面，转移机制探究、免疫微环境互作研究、肿瘤异质性探究等将是今后的研究重点。” 林钊先生  永诺生物副总经理林钊先生 《数字PCR技术在肿瘤精准医学研究中的应用》林钊先生表示，数字PCR技术按照微反应体系分割方法和检测信号采集方法，可以划分为三大类型。数字PCR技术能做对待检靶标进行绝对定量，检出限达到0.01%或更低，主要应用方向为肿瘤筛查和个体化治疗、病原微生物检测、遗传病筛查等。永诺生物开发了自主知识产权的数字PCR检测平台，在肿瘤早筛和治疗预后管理中，在对患者样本检测中，能够达到超高灵敏度和特异性。 孔德举先生
孔德举先生提到目前基因大数据的挑战是：调控基因模式的多样性，数据安全易泄漏，数据技术不成熟。裕策生物针对以上挑战，构建i-See大数据平台，建立DeepIO免疫评估模型，研发TruNeo肿瘤新生抗原算法、IVI-变异自动判级程序，开发YC-Cloud2平台，在应对基因大数据的诸多挑战中发挥了显著作用。 张之越先生  百度智能云高级解决方案工程师张之越先生 《基因测序解决方案》针对目前基因组学研究与应用面临的挑战，百度智能云通过配合容器调度集群、SGE/PBS/slurm调度集群，配合工作流引擎 Cromwell/Nextflow及开源软件，打通云上云下对象存储和文件存储，实现测序二级分析，加入数理统计和机器学习，比对实现三级分析进行基因测序工作。 圆桌讨论  大会概况 ✓ ZAODX世界肿瘤早筛大会 ✓ 时间：7月15-17日 ✓ 地点：中国·广州·长隆国际会展中心  |
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